На протяжении 25 лет вопросами социальной защищенности и повышения качества жизни жителей города Байконур занимается Управление социальной защиты населения. С первых дней образования Управления каждодневная кропотливая работа сотрудников Управления обеспечивает выплату детских пособий, назначение льгот и компенсаций различным категориям граждан. Тысячи граждан, оказавшихся в трудной жизненной ситуации, получили адресную социальную помощь.

В соответствии с приоритетами социально-экономического развития Российской Федерации основными задачами работы Управления являются: смягчение негативных последствий бедности, снижение социального неравенства, повышение эффективности социальных пособий и предоставление помощи ветеранам, инвалидам, малоимущим и другим категориям граждан на основе принципа адресности, повышения качества предоставляемых социальных услуг и помощи.

Годом становления Управления, тогда еще отдела, стал 1996 год. Под чутким руководством своего молодого руководителя Поповой Галины Дмитриевны (1996-2012гг.), силами только четырех сотрудников была проделана огромная работа: налажен порядок назначения и выплаты детских пособий, предоставления льгот инвалидам, ветеранам войны и труда.

Чуть позднее формируется служба социальных работников, которая «берет в свои руки» одиноко проживающих пенсионеров, которые в силу своего возраста не могут позаботиться о себе самостоятельно. В этом же году для малоимущих семей, проживающих в городе, вступает в действие новая программа адресной поддержки по оплате жилищно-коммунальных услуг в виде предоставления жилищных субсидий. В связи с чем, в 1997 году функции по назначению жилищных субсидий передаются в отдел социальной защиты населения. К тому времени численность горожан, состоящих на учете составляет около 5000 человек. Им назначаются детские пособия, льготы по оплате жилья, коммунальных услуг, абонентской плате за телефон. Начинается работа по обеспечению инвалидов техническими средствами реабилитации, бесплатному зубопротезированию граждан пожилого возраста и инвалидов. Продолжается работа по обеспечению социальных гарантий ликвидаторам аварии на Чернобыльской АЭС и ветеранам боевых действий.

К 2000 году количество обслуживаемых граждан увеличивается более чем в два раза. В 2001 году отдел переименовывается в Управление социальной защиты населения, штат которого составляет 18 человек. Число горожан, получающих предусмотренные законодательством Российской Федерации и нормативными правовыми актами администрации города Байконур социальные гарантии и адресную помощь, составляет уже 15 тысяч человек.

В 2003 году по инициативе Управления открывается Центр социальных услуг, который позволил расширить сектор социальных услуг, предоставляемых населению города.

2005 год стал годом кардинальных изменений в системе обеспечения мерами социальной поддержки отдельных категорий граждан. При проведении «монетизации льгот» региональным льготникам ряд льгот был заменен на ежемесячные денежные выплаты. При этом уменьшение объема предоставления социальной помощи льготным категориям не последовало.

С октября 2012 года по июль 2017 года управление социальной защиты населения возглавила Белоконь Елена Владимировна.

С 01 августа 2017 года управление социальной защиты населения возглавляет Шефер Юлианна Рахатовна.

Ветеранами, посвятившими социальной работе 10 лет и более, являются: Попова Г.Д., Е.В. Белоконь, Ю.Р. Шефер, В.Н. Кулепетов, Т.И. Д.С. Ломов, Т.И. Капралова, Г.К. Нуркеева, Ф.Т. Усманова, Т.Т. Усманова, Е.М. Дёмина, А.А. Балгимбаева, О.С. Василенко, А.К. Асанова, Т.В. Григоренко.

Сегодня адресной социальной поддержкой полностью охвачено 9723 граждан, которым производится 113455 выплат.

Помимо предоставления мер социальной поддержки отдельным категориям граждан управление является разработчиком государственной программы: «Обеспечение социальной политики и социальной  поддержки граждан в городе  Байконур на 2021–2024 гг.» и городской целевой программы «Оказание помощи лицам, отбывшим наказание в виде лишения свободы, и лицам, осужденным к наказаниям и мерам уголовно-правового характера без изоляции от общества, и содействие их социальной реабилитации в городе Байконур».

На сегодняшний день штатная численность управления составляет 30 человек. Реализацию функций управления социальной защиты населения осуществляют 5 отделов: отдел социальных выплат, отдел обеспечения государственных гарантий, сектор по работе с семьями, отдел экономики и финансов, хозяйственный отдел.